Было обнаружено три комбинации регуляторных участков гена ASIP, вызывающие подпалый окрас - к его формированию приводят комбинации VP2 с HCP3, HCP4 или HCP5.

У подпалых собак на верхней поверхности ген ASIP практически не активен, поскольку HCP3, HCP4 и HCP5 являются поврежденными регуляторными участками, которые не могут обеспечивать нормальную активность этого гена в коже на спине.

В то же время, активность гена ASIP на нижней поверхности ниже, чем в случае аллеля asa, так что феомеланиновый окрас распространяется гораздо слабее. Поэтому у подпалых собак на голове формируется зона, преимущественно окрашенная темным эумеланином.

По-видимому, промежуточный вариант окраса "с шапочкой" наблюдается у гетерозигот asa/at (VP1+HCP4/VP2+HCP3-5), у которых присутствие одной копии VP1 позволяет отодвинуть эумеланиновый окрас на голове за глаза (см. рисунок ниже).

Важно упомянуть, что в этом варианте тест на комбинации регуляторных участков позволяет правильно соотносить генотип с фенотипом даже в тех породах, в которых тестирование на дупликацию в гене RALY было неинформативным и не использовалось.