Само существование отдельного аллеля, связанного с формированием зачерненного рыжего окраса долгое время оставалось под сомнением, поскольку не существовало методов, которые могли бы отличить этот аллель от аллеля Ay. Теперь такая возможность появилась. Аллелю зачерненного рыжего Ays (Ay shaded, затемненный Ay) соответствует комбинация VP2+HCP1.

На нижней стороне тела активность гена ASIP контролирует регуляторный участок VP2, который, как и в случае аллеля aw, приводит к преимущественно светлой феомеланиновой окраске шерсти. Этот регуляторный участок является более слабым активатором, чем VP1, и его активность распространяется на меньшую поверхность кожи в направлении спины. Поэтому на верхней стороне тела активность гена ASIP в большей степени находится под контролем HCP1.

Регуляторный участок HCP1, который преимущественно активен на верхней стороне тела, вызывает циклическую активацию гена ASIP. Как и в случае аллеля aw, в начале роста волоса его активность снижена, поэтому меланоциты производят эумеланин, что приводит к более темной окраске на кончике волоса. Однако под действием HCP1 концентрация белка ASIP возрастает быстрее, поэтому темно окрашенная зона на конце волоса короче, чем в случае аллеля aw.